【小刚：阿蜜馆主，黑小智的实力都往天王那靠了，输给他很正常！】

【小茂：要是用皮卡丘或者喷火龙它们，恐怕战斗结束得更快。】

.......

黑光幕黯淡下来，白光幕亮起来。

因为要前往下一个道馆，所以小智一行人要回到了圆朱市。

大木博士打电话来，说研究所后院有个大麻烦，毽子草、毽子花、毽子棉随着季风飘过来，和走路草、臭臭花、霸王花、美丽花因为水源的问题而引起了争斗，而且水系宝可梦也跟它们发生了争斗。

大木博士考虑到小智的妙蛙种子以前在宝可梦乡有照顾其它的宝可梦的经验，便让小智就把妙蛙种子传送了回去。

妙蛙种子一开始对这些争斗中的宝可梦进行了劝说，但都不搭理它鳄，而且还遭到了攻击，妙蛙种子使用了阳光烈焰，那些草系宝可梦才认可妙蛙种子。

接着妙蛙种子便为了解决这个水源问题，让宝可梦们一起开凿一个新的湖泊。

从而妙蛙种子就在大木研究所当了大哥，只有妙蛙种子在，研究院才不会出现纠纷。

大木博士请求小智暂时将妙蛙种子留在那里，小智答应了下来。

小智一行人来到了园朱市，就听到了铃铛塔的异样，赶过去见到了道馆馆主小松和水京。

从他们那里得知铃铛塔的异样是因为被偷走了铃铛。

当时被烧焦的塔里面只有四个透明的铃铛和三十二个传达凤王意志的铃铛，都被奇迹般地留了下来。

就在重建的塔里，铃铛又被挂了起来，但那之后铃铛一次都没有响过。

这次是响大概是因为提醒他们铃铛被偷了。

交谈中，水京得知了小智也见过水君，立马要跟小智进行决斗。

而另一边的火箭队三人组不慎把其中的一个透明铃铛给打碎，遭到了虫系宝可梦的怒火，另外，还用丝线覆盖了整座城市。

最后是水君出来救场。

后面彩虹出现，宝可梦们的愤怒都被平息！