在他们兄弟二人死后，林衍立即率领士兵将他们家屠戮一空，并派人捕杀金氏家族的成员和同党，自己也趁机笼络了一大批的朝臣，摇身一变，成为了武臣集团的新任领袖，开始执掌朝政。

可他的这一举动让王禃十分不满，王禃本想利用林衍除掉金仁俊，而后将武臣集团彻底摧毁，自己夺回朝中大权，却没成想被林衍给半路摘了桃子，夺取了本该属于自己的权力。

这让他对林衍也动了杀心。

林衍也不傻，他知道自己的这一行为肯定会引起王禃的强烈不满，所以在夺权之后便立即将矛头对准了王禃，并在次年六月罢黜了他的国王之位，拥立王禃的弟弟庆安公王淐为王，自己担任监国，实则掌控大权。

王禃此人，在本质上就是忽必烈安插在高丽的代言人，未经他的允许就私自改换代言人无疑是在挑战蒙古帝国的权威，所以在这个消息传到了中都之后，忽必烈便立即遣使前往高丽，要求他们调查清楚这件事。

为了掩盖真相，林衍急忙将王禃尊为太上王，并将他软禁起来，防止他跟蒙古使者私下沟通，并向蒙古使者表示，王禃是因为重病才不得不退位的，并辩称自己的高丽国内不过是排名第八的官员，没有废立一国之君的权力。

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使者将他的这一番话如实回报，但忽必烈是何等的人物？

林衍这番话骗骗小孩还行，骗他这种有着雄才大略的君主，简直就是天方夜谭。

但忽必烈此时也意识到了高丽国中的情况似乎有些复杂，为了将事情调查清楚，同时也是为了向世人表态——蒙古帝国的权威不容置疑，他派国王头辇哥（木华黎的后代，世代被封为国王）率军进入高丽准备进行武力弹压，同时任命重臣赵壁为东京行省平章政事，前往高丽进行招抚工作。

至元六年（1269年）十一月，忽必烈又派兵部侍郎等官员前往高丽，传达他的旨意，召王禃、王淐和林衍入中都朝拜，同时还下令恢复王禃的王位。

在蒙古大军的武力逼迫下，林衍不得不屈服。

十一月二十三日，王禃复位，但高丽国的实权依然掌握在林衍的手中。

十二月十九日，王禃应忽必烈的旨意，启程前往中都，林衍因为内心有鬼，所以不愿前去，但又不敢违背忽必烈的旨意，于是派自己的儿子林惟干随同入朝。

至元七年（1270年）二月初一，王禃抵达中都，并亲自面见了忽必烈。

由于脱离了林衍的掌控，王禃一把鼻涕一把泪地向忽必烈哭诉了自己这几年来的惨状，并将自己退位的内情如实相告，忽必烈闻言大怒，立即下令逮捕了林惟干，并发兵护送王禃等人返回高丽，铲除林衍等武臣集团的成员。

当这个消息传到了高丽国内之时，林衍十分害怕，惊惧之下竟一病不起，并于二月二十五日一命呜呼，结束了自己睚眦必报的一生。

在他死后，他的另一个儿子林惟茂继承了他的职位，企图利用自己的势力做最后的抵抗，但却被其余忠于高丽王室的朝臣所联合铲除，将其生擒之后斩首于市，彻底结束了武臣集团控制高丽上百年的历史。

高丽的政权也在蒙古人的帮助下，终于回到了王室的手中。

为了报答忽必烈的大恩大德，王禃回到高丽之后的第一件事便是将‘出水入陆’的进程加快，于当年将都城从江华岛迁回了开京。

除此之外，由于担心武臣集团死灰复燃，王禃也不遗余力的对他们的残余势力展开了大清洗。

不过正所谓，哪里有压迫哪里就会有反抗，以‘三别抄’首领裴仲孙为首的武臣集团余孽为了活命，拥立了高丽王室庶族中的承化侯王温为国王，并带着大批军马迁入珍岛（今韩国全罗南道），打着抵抗蒙元的旗号组成义军，坚持与王禃及元军作战。

对于这些胆敢反抗蒙古统治的人，忽必烈的做法只有一个，那就是杀！

至元七年（1270年）初，忽必烈命大将忻都、史枢为凤州经略使，领军屯驻于金州，负责剿灭裴仲孙等人所率的高丽义军。