菲利普一世在试图吞并大马士革后几乎无迹可寻，而在安条克十二世死后，大马士革失去了保护者。

为了防范伊图雷亚王国（Iturea）的统治者托勒密（Ptolemy），大马士革的民众邀请纳巴泰（Nabataea）国王阿雷塔斯三世（Aretas III）接管城市。

钱币学家奥利弗·D·胡佛（Oliver D. Hoover）认为阿雷塔斯三世在大马士革的统治并不长久，之后城市重新回到塞琉古统治。

关于安条克十二世的妻子身份仍然没有确切的记载，但根据六世纪历史学家约翰·马拉拉斯（John Malalas）的说法（虽然学者普遍认为他的着作不太可靠），国王有两个女儿，分别是克利奥帕特拉（Cleopatra）和安条基斯（Antiochis）。

在安条克十世去世后，公元前89/88年，藏匿起来的克利奥帕特拉·塞勒尼（Cleopatra Selene）利用安条克十二世的死，宣布她的儿子安条克十三世（Antiochus XIII）为国王。

她自己成为摄政王和新的女王。

在她的摄政期间铸造的硬币显示其为大马士革铸币厂所铸。

然而，最后一位塞琉古国王实际上是安条克十三世（Antiochus XIII），他在公元前64年被推翻，之后，安条克被罗马吞并。

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安条克十三世继父亲安条克十世去世后登上了王位，时间大约在公元前92年到公元前85年之间。

新国王年幼，他的母亲，托勒密王朝的叙利亚公主克利奥帕特拉·塞勒尼（Cleopatra Selene）成为了摄政王。

公元前83年，提格兰二世（Tigranes II）征服叙利亚后，克利奥帕特拉·塞勒尼前往罗马，试图使她的儿子被承认是埃及的国王，但没有成功。

然而，在公元前75年到公元前73年之间，他们被承认是“叙利亚的国王”，并“维持了王室地位”。

克利奥帕特拉·塞勒尼最终被提格兰二世捕获并杀害。

之后，提格兰二世被卢修斯·李基纽斯·卢库卢斯（Lucius Licinius Lucullus）在提格拉诺切塔战役（Battle of Tigranocerta）中击败后，安条克十三世被安条克居民拥立为国王，卢库卢斯批准他成为叙利亚的附庸王。

公元前64年，庞培（Pompey）通过叙利亚酋长桑比塞拉穆斯一世（Sampsiceramus I）废除了安条克十三世的王位并将其杀害。

安条克的去世通常被认为标志着塞琉古王朝的终结。

但是，菲利普二世·菲洛罗马乌斯（Philip II Philoromaeus）继承了王位，他只是一个微不足道的棋子，统治时间短暂。

他可能娶了埃及的女王贝蕾尼丝四世（Berenice IV），但因为缺乏礼貌被新娘杀死。