朱由校现在已经习惯有事先问问这些大臣的意见，如果有好的想法，也能对自己的计划做修改。

“陛下，当务之急，是尽快组织人手建立统治秩序，尽快恢复当地的稳定！”内阁首辅张威率先说道。

“嗯，朕有意和中南半岛一样，前期建立四个都指挥使司管理，包括吕宋都指挥使司、渤泥都指挥使司、爪哇都指挥使司以及旧港都指挥使司，废除旧港宣慰司！”

“另外设立南洋总督，以熊廷弼为总督！”

这都是之前就确定的，众人也没有意见。

“陛下，不知南洋驻军如何安排？”五军都督府老大张维贤问道。

“目前中南半岛已经基本平静了，有那些守备军足够用了。平南军在南方补充战损后，有十二万大军。让他们留下一营驻扎在靖南都指挥使司，用来震慑中南半岛以及莫卧儿。剩余五个营，一个驻守在旧港周边，守卫海峡，两个营驻扎在爪哇都指挥使司，还有两个营调到吕宋，将京营替换下来，京营南军调回京城！”

顿了顿，朱由校接着说道，“征南军三个营，留一个在交趾都指挥使司，镇压当地，其余两个营驻扎在渤泥都指挥使司。各地驻军要尽快将那些土着都镇压了！”

“是，臣明白了！”对于朱由校的安排，张维贤直接称是。

“陛下，不知南洋之后的具体安排是何？”这时，新任南洋总督熊廷弼问道，他上任之前必须知道朱由校和朝廷的态度。

“南洋现在开发度极低，你首要任务就是在稳定南洋后召集那些土着开荒修路，那是以后我大明百姓的家园，可要建好一些！”

“臣遵旨！”

“陛下，关于那些洋人俘虏该怎么处理？”

朱由校说道，“之前西班牙人在吕宋搞大屠杀，针对华人，将那些当官的西班牙人都处死，至于其他的，全部留在当地开荒修路，和东番一样，也是给死去的人赎罪了。”

“至于荷兰人和葡萄牙人，当官的和士兵都留下开荒，至于那些商人，如果没有和我大明作对，就放了吧！”

之所以放了那些商人，主要是为了以后的贸易，要是把他们都杀了，就怕以后没人来了。现在大明还没有向欧洲开拓的想法，留着他们还有用。