于是，朱棣在南京登基后不久，便发两路大军从福建沿海地区以及广西与湖南交界包抄岭南地区。

几个月后，明军大获全胜，源源不断钱财和物资从岭南运往南京！

在广西作战时，由于明军没有精确军事地图（中国的军用地图都让朱允炆带走了！）在追击藩王残余时误入越南境内。

此时，越南人已经知道朱棣在南京登基，于是越南朝廷派使者到南京，向朱棣投诉明军的侵略行为！

朱棣听了越南使节陈述后，勃然大怒！当场扣留越南使节，并用快马统治驻扎广西的明军部队，攻打越南！

这支明军部队不愧是朱棣的虎狼之师，他们如秋风扫落叶一般，很快解放了越南全境！

明军打到越南首都顺化时，几万工匠正在扩建越南朝廷皇宫，明军主帅知道朱棣要迁都北京，正在为建设北京皇城即紫禁城，没有设计师和工匠而发愁（朱允炆考虑到自己到新地方要建设宫殿因此他将朝廷关于建筑宫殿方面模型、图纸、设计师和工匠都带走了），因此明军将这几万人全部扣押，并押往南京交给朱棣。

朱棣一看建造宫殿钱和人都有了，他留下镇守南京及南方各地将帅和官员后，他马上带领明军主力和朝廷文武百官杀回北京。

之后，朱棣在建设紫禁城的同时，疏通和扩建京杭大运河，恢复南北漕运，将南方钱粮和物资运往北方。

明朝稍微安定后，朱棣开始治理中国北方。

由于四年争夺帝王的内战，明朝北方已经四分五裂，四川和湖北处于半独立状态，河南、陕西、山西和山东一带匪患猖獗，中国西北地区和北方地区又被蒙古和突厥占领。

因此，明军四处出击，去平定这些地区。

不久，中国北方得以安定，但是，中国西北地区和北方地区蒙古和突厥势力久攻不退。

于是，朱棣几次御驾亲征，深入大漠戈壁讨伐蒙古和突厥，最终全部收复北方失地，并在新疆哈密，设立哈密卫镇守明朝西域领土。

1405年北方战争进入尾声后，朱棣派宦官郑和，以开拓商贸航线为由，带领明朝舰队下南洋寻找朱允炆踪迹。

看到这里有人要问：朱棣确实知道朱允炆逃跑了？

当然知道，朱棣军的人、南京明朝廷的人和南京市民都认为朱允炆跑了，因为朱允炆带着十几万人，还有上万吨的器械和物资逃跑，不可能一点风声和痕迹都不留下吧？！