902年，岛屿作为海盗基地的频繁使用激怒了名义上的统治者科尔多瓦酋长国（Emirate of Córdoba），促使其入侵并将这些岛屿并入其领土。

然而，科尔多瓦酋长国在11世纪初陷入内战和分裂，分裂为更小的塔伊法（taifa）国家（安达卢斯章节曾提到过这段历史）。

1015年，德尼亚（Dénia）塔伊法的统治者穆贾希德·阿尔-西克拉比（Mujahid al-Siqlabi）派遣舰队并控制了这些岛屿，并将其作为随后进攻撒丁岛（Sardinia）和比萨（Pisa）的基地。

1050年，岛上的总督阿卜杜拉·伊本·阿格拉布（Abd Allah ibn Aglab）叛乱并建立了独立的马略卡塔伊法（Taifa of Mallorca）。

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几个世纪以来，巴利阿里群岛的水手和海盗一直是西地中海的主宰。

然而，随着意大利海上共和国影响力的扩大，以及伊比利亚半岛上从穆斯林国家向基督教国家的权力转移，岛屿变得脆弱不堪。

1113年，一场十字军远征发起。

此次远征由比萨共和国（Republic of Pisa）的乌戈·达·帕拉西奥·埃布里亚科（Ugo da Parlascio Ebriaco）和大主教皮埃特罗·莫里科尼（Pietro Moriconi）领导，远征包括420艘船只和一支庞大的军队，以及教皇帕斯卡尔二世（Pope Paschal II）的私人使节。

除了比萨人（Pope承诺他们对这些岛屿拥有宗主权），远征队还包括来自佛罗伦萨、卢卡、皮斯托亚、罗马、锡耶纳和沃尔泰拉的意大利城市的部队，以及撒丁岛和科西嘉岛的部队。

来自西班牙的加泰罗尼亚军队由拉蒙·贝伦格尔（Ramon Berenguer）、阿姆普里斯的乌戈二世（Hug II of Empúries）和拉蒙·福尔克二世·德·卡多纳（Ramon Folc II of Cardona）领导，来自法国的奥克西塔尼军队由蒙彼利埃的威廉五世（William V of Montpellier）、纳博讷的艾梅里二世（Aimery II of Narbonne）和博克斯的雷蒙一世（Raymond I of Baux）领导。

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远征还得到了罗古多罗的康斯坦丁一世（Constantine I of Logudoro）和他位于波尔托托雷斯（Porto Torres）的基地的有力支持。

1115年，十字军攻陷了帕尔马（Palma），并且大幅削弱了这些岛屿，结束了它们作为海上大国的时代，随后撤退。

不到一年时间，现在分崩离析的岛屿被柏柏尔人的阿尔摩拉维德王朝（Almoravid dynasty）征服，其宗教的激进、好战风格与十字军相似，与科尔多瓦和塔伊法时期岛屿的宽容历史背道而驰。

1147年，阿尔摩拉维德王朝被对手——马拉喀什的阿尔莫哈德王朝（Almohad Dynasty）在北非和伊比利亚半岛上征服并推翻（安达卢斯 - 5）。

阿尔摩拉维德的继承人穆罕默德·伊本·加尼亚（Muhammad ibn Ganiya）逃亡帕尔马，并在那里建立了他的首都。

他的王朝——巴努·加尼亚（Banu Ghaniya），在试图从阿尔莫哈德王朝手中夺回王国时寻求盟友，允许热那亚（Genoa）和比萨首次在岛屿上获得商业特权。

1184年，一支远征队被派遣去夺回伊夫里基亚（Ifriqiya，今突尼斯、东阿尔及利亚和利比亚西部的沿海地区），但最终失败。